组织医疗机构及医务人员、医疗技术应用、医疗质量和安全、医疗服务采供血机构管理以及行风建设等行业管理政策规范、标准的监督和实施，承担推进护理、康复事业发展工作。拟订公立医院运行监管、绩效评价和考核制度。
贯彻执行中医、民族医法律、法规和政策；拟订全县中医药民族医药发展和人才培养规划，组织指导中医药民族医药保护、挖掘、整理、开发和利用；指导中医药民族医药临床应用推广；推进全县中医药民族医药产业化建设。负责中医药事业建设项目管理；负责中医医疗、预防、保健、康复及临床用药等监督管理；监督和协调医疗研究机构的中西医结合工作。
拟订卫生健康科技发展规划，组织实施卫生科技相关政策。承担实验室生物安全监督等工作。